Untuk melaksanakan fungsi dan tugasnya, LPPM dipimpin oleh seorang Ketua dan dapat dibantu oleh seorang Sekretaris. Manajemen LPPM sebagaimana digambarkan pada Struktur Organisasi LPPM tersusun sebagai berikut:
Ketua : Prof. Dr. Ida Hamidah, M.Si.
Sekretaris : Prof. Dr. Lala Septem Riza, M.T.
Pejabat Administrasi
• Kasi Pengelolaan Penelitian
• Kasi Pengelolaan Pengabdian kepada Masyarakat
• Kasi Pengelolaan Administrasi Umum dan Sumber Daya
Kepala Pusat Kajian
• Pusat Kajian Ekonomi Kreatif, Kewirausahaan dan Industri Pariwisata
• Pusat Kajian Pemberdayaan Masyarakat dan Pengembangan Kuliah Kerja Nyata
• Pusat Kajian Gender dan Anak
• Pusat Kajian Inovasi Pendidikan dan Literasi
• Pusat Kajian Kebijakan Publik, Kependudukan, dan Keragaman Budaya
• Pusat Kajian Sains, Teknologi, dan Lingkungan Hidup